村镇银行持股制度是指允许非金融机构投资者持有村镇银行股份的制度。其利弊如下：

利：

1. 引入持股机构：村镇银行持股制度可以吸引更多的持股机构进入村镇银行股权结构，增加了村镇银行的资本实力和市场竞争力。

2. 增加融资渠道：持股机构的投资可以为村镇银行提供更多的融资渠道，增加了其发展资金来源，有助于提高村镇银行的业务规模和发展速度。

3. 优化公司治理结构：持股机构的参与可以引入先进的企业管理经验和治理模式，提升村镇银行的公司治理水平，提高经营效率和风险控制能力。

4. 促进金融创新：持股机构的参与可以为村镇银行带来更多的金融创新理念和产品，推动村镇银行的业务多元化和创新能力。

弊：

1. 产权安全隐患：村镇银行持股制度引入的持股机构可能对村镇银行的业务决策产生较大影响，可能导致村镇银行的独立性和战略方向受到侵蚀。

2. 利益冲突风险：持股机构的利益追求可能与村镇银行的公益性质相冲突，导致村镇银行在服务农村和中小微企业等特定领域时出现利益偏重或倾向于追求高风险高回报的行为。

3. 风险传导问题：如果村镇银行的持股机构出现经营困难或风险暴露，可能会对村镇银行的经营和稳定性产生负面影响，增加村镇银行的风险敞口。

4. 合规监管难度：引入持股机构后，监管部门需要加强对村镇银行及其持股机构的监管工作，确保其合规经营，但监管难度可能增加。

总体而言，村镇银行持股制度的实施可以为村镇银行带来更多的发展机遇和资本支持，但也需要注意管理风险和监管合规的问题。